Эстония присоединилась к НАТО 2 апреля 2004 года. Сейчас от Эстонии в различных операциях НАТО принимает участие 336 военнослужащих. Это, если считать пропорционально, исходя из численности населения Эстонии, является одним из самых больших вкладов в НАТО.
Эстонские военнослужащие принимают участие в операциях НАТО в Косово, Ираке и Афганистане.
Эстония доказала свой потенциал и благонадежность в сфере киберзащиты, и в мае 2008 года в Таллинне был основан Центр компетенции киберзащиты. 28 октября 2008 года центр получил статус международной организации и аккредитацию в качестве центра компетенции НАТО.
